Protein–RNA interactions for Protein: P49593

PPM1F, Protein phosphatase 1F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1FP49593 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1FP49593 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1FP49593 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPM1FP49593 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1FP49593 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPM1FP49593 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPM1FP49593 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms