Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL21P46778 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL21P46778 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL21P46778 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL21P46778 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL21P46778 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL21P46778 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL21P46778 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL21P46778 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL21P46778 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL21P46778 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL21P46778 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL21P46778 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL21P46778 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL21P46778 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL21P46778 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL21P46778 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL21P46778 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL21P46778 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL21P46778 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL21P46778 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL21P46778 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL21P46778 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL21P46778 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL21P46778 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL21P46778 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL21P46778 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL21P46778 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL21P46778 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL21P46778 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL21P46778 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL21P46778 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL21P46778 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL21P46778 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL21P46778 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL21P46778 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL21P46778 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL21P46778 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL21P46778 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL21P46778 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL21P46778 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL21P46778 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL21P46778 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL21P46778 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL21P46778 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL21P46778 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL21P46778 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL21P46778 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL21P46778 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL21P46778 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPL21P46778 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL21P46778 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL21P46778 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL21P46778 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL21P46778 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL21P46778 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL21P46778 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL21P46778 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL21P46778 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL21P46778 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL21P46778 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL21P46778 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL21P46778 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL21P46778 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL21P46778 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL21P46778 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL21P46778 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL21P46778 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL21P46778 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL21P46778 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL21P46778 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL21P46778 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL21P46778 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL21P46778 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL21P46778 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL21P46778 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms