Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASRP41180 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASRP41180 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASRP41180 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASRP41180 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASRP41180 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASRP41180 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASRP41180 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASRP41180 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASRP41180 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASRP41180 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASRP41180 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASRP41180 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASRP41180 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASRP41180 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASRP41180 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASRP41180 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASRP41180 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASRP41180 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASRP41180 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASRP41180 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASRP41180 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASRP41180 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASRP41180 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASRP41180 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASRP41180 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASRP41180 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASRP41180 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASRP41180 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASRP41180 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASRP41180 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASRP41180 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASRP41180 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASRP41180 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASRP41180 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASRP41180 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASRP41180 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASRP41180 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASRP41180 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASRP41180 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASRP41180 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASRP41180 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASRP41180 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASRP41180 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASRP41180 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CASRP41180 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASRP41180 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASRP41180 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASRP41180 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASRP41180 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASRP41180 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASRP41180 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASRP41180 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASRP41180 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASRP41180 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASRP41180 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASRP41180 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASRP41180 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASRP41180 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms