Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HNF1BP35680 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HNF1BP35680 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HNF1BP35680 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HNF1BP35680 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HNF1BP35680 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms