Protein–RNA interactions for Protein: P35579

MYH9, Myosin-9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH9P35579 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH9P35579 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH9P35579 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH9P35579 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH9P35579 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH9P35579 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH9P35579 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH9P35579 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH9P35579 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH9P35579 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH9P35579 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH9P35579 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH9P35579 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH9P35579 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH9P35579 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH9P35579 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH9P35579 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH9P35579 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH9P35579 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH9P35579 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH9P35579 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH9P35579 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH9P35579 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH9P35579 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH9P35579 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH9P35579 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH9P35579 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH9P35579 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH9P35579 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH9P35579 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH9P35579 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH9P35579 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH9P35579 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH9P35579 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH9P35579 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH9P35579 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH9P35579 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH9P35579 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH9P35579 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH9P35579 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH9P35579 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH9P35579 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH9P35579 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH9P35579 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH9P35579 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH9P35579 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH9P35579 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH9P35579 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH9P35579 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH9P35579 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH9P35579 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH9P35579 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH9P35579 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH9P35579 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH9P35579 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH9P35579 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH9P35579 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH9P35579 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH9P35579 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms