Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CXCR5P32302 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCR5P32302 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXCR5P32302 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXCR5P32302 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.4 ms