Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC13P31276 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC13P31276 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC13P31276 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC13P31276 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms