Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB9P28065 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB9P28065 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB9P28065 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB9P28065 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB9P28065 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms