Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLNP26678 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLNP26678 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLNP26678 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLNP26678 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLNP26678 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLNP26678 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLNP26678 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLNP26678 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLNP26678 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLNP26678 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLNP26678 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLNP26678 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLNP26678 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLNP26678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLNP26678 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLNP26678 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLNP26678 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLNP26678 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLNP26678 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLNP26678 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLNP26678 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLNP26678 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLNP26678 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLNP26678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLNP26678 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLNP26678 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLNP26678 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLNP26678 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLNP26678 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLNP26678 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLNP26678 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLNP26678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLNP26678 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLNP26678 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLNP26678 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLNP26678 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLNP26678 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLNP26678 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLNP26678 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms