Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD247P20963 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD247P20963 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD247P20963 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD247P20963 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD247P20963 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD247P20963 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD247P20963 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD247P20963 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD247P20963 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD247P20963 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD247P20963 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD247P20963 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD247P20963 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD247P20963 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD247P20963 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD247P20963 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD247P20963 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD247P20963 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD247P20963 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD247P20963 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD247P20963 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD247P20963 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD247P20963 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD247P20963 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD247P20963 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD247P20963 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD247P20963 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD247P20963 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD247P20963 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD247P20963 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD247P20963 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD247P20963 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD247P20963 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD247P20963 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD247P20963 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD247P20963 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD247P20963 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD247P20963 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD247P20963 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD247P20963 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD247P20963 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD247P20963 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD247P20963 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD247P20963 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD247P20963 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD247P20963 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD247P20963 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD247P20963 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD247P20963 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD247P20963 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD247P20963 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD247P20963 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD247P20963 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD247P20963 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD247P20963 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD247P20963 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD247P20963 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms