Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCN2P20062 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCN2P20062 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCN2P20062 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCN2P20062 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCN2P20062 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCN2P20062 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN2P20062 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN2P20062 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN2P20062 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN2P20062 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN2P20062 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN2P20062 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN2P20062 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN2P20062 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN2P20062 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN2P20062 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN2P20062 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN2P20062 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN2P20062 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN2P20062 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN2P20062 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN2P20062 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN2P20062 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN2P20062 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN2P20062 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCN2P20062 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCN2P20062 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCN2P20062 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN2P20062 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN2P20062 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN2P20062 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN2P20062 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN2P20062 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN2P20062 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN2P20062 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN2P20062 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN2P20062 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN2P20062 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN2P20062 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN2P20062 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN2P20062 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN2P20062 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN2P20062 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN2P20062 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN2P20062 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCN2P20062 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN2P20062 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN2P20062 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN2P20062 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN2P20062 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN2P20062 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN2P20062 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCN2P20062 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN2P20062 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN2P20062 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms