Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRAP18433 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRAP18433 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRAP18433 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRAP18433 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRAP18433 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRAP18433 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRAP18433 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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