Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCP1P13796 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCP1P13796 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LCP1P13796 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCP1P13796 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCP1P13796 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCP1P13796 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCP1P13796 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCP1P13796 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCP1P13796 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCP1P13796 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCP1P13796 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCP1P13796 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LCP1P13796 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCP1P13796 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCP1P13796 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCP1P13796 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCP1P13796 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCP1P13796 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCP1P13796 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCP1P13796 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCP1P13796 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCP1P13796 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCP1P13796 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCP1P13796 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCP1P13796 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCP1P13796 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCP1P13796 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCP1P13796 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCP1P13796 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCP1P13796 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCP1P13796 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCP1P13796 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LCP1P13796 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCP1P13796 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCP1P13796 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCP1P13796 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LCP1P13796 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCP1P13796 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCP1P13796 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCP1P13796 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCP1P13796 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCP1P13796 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCP1P13796 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCP1P13796 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCP1P13796 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCP1P13796 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCP1P13796 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCP1P13796 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCP1P13796 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCP1P13796 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCP1P13796 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCP1P13796 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCP1P13796 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LCP1P13796 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms