Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARBP10826 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARBP10826 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARBP10826 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARBP10826 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RARBP10826 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARBP10826 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARBP10826 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RARBP10826 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RARBP10826 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARBP10826 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARBP10826 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARBP10826 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARBP10826 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARBP10826 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARBP10826 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RARBP10826 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARBP10826 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARBP10826 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARBP10826 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RARBP10826 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARBP10826 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARBP10826 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RARBP10826 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARBP10826 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RARBP10826 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARBP10826 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RARBP10826 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARBP10826 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARBP10826 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARBP10826 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARBP10826 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARBP10826 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARBP10826 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RARBP10826 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARBP10826 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARBP10826 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARBP10826 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARBP10826 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARBP10826 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARBP10826 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARBP10826 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARBP10826 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RARBP10826 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARBP10826 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARBP10826 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARBP10826 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARBP10826 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARBP10826 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARBP10826 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARBP10826 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARBP10826 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARBP10826 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARBP10826 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARBP10826 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARBP10826 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARBP10826 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARBP10826 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARBP10826 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARBP10826 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARBP10826 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARBP10826 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARBP10826 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARBP10826 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARBP10826 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms