Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI4P10075 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI4P10075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI4P10075 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI4P10075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI4P10075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI4P10075 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI4P10075 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI4P10075 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI4P10075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI4P10075 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI4P10075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI4P10075 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI4P10075 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI4P10075 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI4P10075 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI4P10075 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI4P10075 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI4P10075 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI4P10075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI4P10075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI4P10075 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI4P10075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI4P10075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI4P10075 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI4P10075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI4P10075 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI4P10075 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI4P10075 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI4P10075 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI4P10075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI4P10075 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI4P10075 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI4P10075 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI4P10075 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI4P10075 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI4P10075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI4P10075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI4P10075 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI4P10075 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI4P10075 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI4P10075 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI4P10075 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI4P10075 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI4P10075 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI4P10075 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI4P10075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms