Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN8OSP0DMR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN8OSP0DMR3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN8OSP0DMR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms