Protein–RNA interactions for Protein: P04908

HIST1H2AB, Histone H2A type 1-B/E, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2ABP04908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2ABP04908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2ABP04908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2ABP04908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H2ABP04908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H2ABP04908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2ABP04908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2ABP04908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2ABP04908 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2ABP04908 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2ABP04908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1291.5 ms