Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CILPO75339 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CILPO75339 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CILPO75339 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CILPO75339 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CILPO75339 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CILPO75339 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CILPO75339 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CILPO75339 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CILPO75339 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CILPO75339 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CILPO75339 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CILPO75339 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CILPO75339 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CILPO75339 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CILPO75339 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CILPO75339 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CILPO75339 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CILPO75339 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CILPO75339 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CILPO75339 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CILPO75339 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CILPO75339 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CILPO75339 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CILPO75339 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CILPO75339 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CILPO75339 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CILPO75339 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CILPO75339 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CILPO75339 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CILPO75339 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CILPO75339 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CILPO75339 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CILPO75339 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CILPO75339 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CILPO75339 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CILPO75339 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CILPO75339 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CILPO75339 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CILPO75339 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CILPO75339 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CILPO75339 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CILPO75339 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CILPO75339 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CILPO75339 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CILPO75339 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CILPO75339 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CILPO75339 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CILPO75339 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CILPO75339 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CILPO75339 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CILPO75339 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CILPO75339 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CILPO75339 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CILPO75339 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CILPO75339 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CILPO75339 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CILPO75339 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CILPO75339 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CILPO75339 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CILPO75339 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CILPO75339 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CILPO75339 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CILPO75339 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CILPO75339 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CILPO75339 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CILPO75339 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CILPO75339 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CILPO75339 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CILPO75339 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CILPO75339 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CILPO75339 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms