Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF4O60810 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF4O60810 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF4O60810 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF4O60810 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF4O60810 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF4O60810 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF4O60810 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF4O60810 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms