Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD2O60548 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD2O60548 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD2O60548 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD2O60548 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms