Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR1O43759 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR1O43759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGR1O43759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR1O43759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms