Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNGR1O43759 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNGR1O43759 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNGR1O43759 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNGR1O43759 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNGR1O43759 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNGR1O43759 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNGR1O43759 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNGR1O43759 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNGR1O43759 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGR1O43759 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGR1O43759 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNGR1O43759 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNGR1O43759 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNGR1O43759 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGR1O43759 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNGR1O43759 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNGR1O43759 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNGR1O43759 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNGR1O43759 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNGR1O43759 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNGR1O43759 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNGR1O43759 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGR1O43759 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGR1O43759 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGR1O43759 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGR1O43759 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGR1O43759 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGR1O43759 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGR1O43759 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGR1O43759 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNGR1O43759 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGR1O43759 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNGR1O43759 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGR1O43759 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNGR1O43759 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGR1O43759 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNGR1O43759 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNGR1O43759 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNGR1O43759 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGR1O43759 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGR1O43759 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGR1O43759 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGR1O43759 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGR1O43759 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGR1O43759 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGR1O43759 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNGR1O43759 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNGR1O43759 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGR1O43759 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGR1O43759 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGR1O43759 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGR1O43759 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGR1O43759 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGR1O43759 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGR1O43759 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGR1O43759 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNGR1O43759 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGR1O43759 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNGR1O43759 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGR1O43759 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGR1O43759 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNGR1O43759 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGR1O43759 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGR1O43759 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNGR1O43759 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGR1O43759 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNGR1O43759 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNGR1O43759 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGR1O43759 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNGR1O43759 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNGR1O43759 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNGR1O43759 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGR1O43759 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGR1O43759 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGR1O43759 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGR1O43759 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGR1O43759 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNGR1O43759 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGR1O43759 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGR1O43759 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGR1O43759 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGR1O43759 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGR1O43759 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGR1O43759 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGR1O43759 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGR1O43759 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGR1O43759 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGR1O43759 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGR1O43759 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGR1O43759 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGR1O43759 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGR1O43759 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGR1O43759 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNGR1O43759 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNGR1O43759 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNGR1O43759 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGR1O43759 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNGR1O43759 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGR1O43759 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms