Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CBFA2T2O43439 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBFA2T2O43439 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBFA2T2O43439 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CBFA2T2O43439 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CBFA2T2O43439 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBFA2T2O43439 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms