Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A1O15245 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A1O15245 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC22A1O15245 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A1O15245 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A1O15245 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms