Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2LH3BP13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC2LH3BP13 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LH3BP13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LH3BP13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms