Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BML4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BML4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BML4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BML4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BML4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BML4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BML4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BML4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BML4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BML4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BML4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BML4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BML4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BML4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BML4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BML4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BML4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BML4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BML4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BML4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BML4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BML4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BML4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BML4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BML4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BML4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BML4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BML4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BML4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BML4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BML4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BML4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BML4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BML4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BML4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BML4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BML4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BML4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BML4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BML4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BML4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BML4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BML4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BML4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BML4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BML4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BML4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BML4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BML4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BML4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BML4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BML4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BML4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BML4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BML4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BML4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BML4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BML4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BML4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BML4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BML4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BML4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BML4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BML4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BML4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BML4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms