Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms