Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXI3A8MTJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXI3A8MTJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXI3A8MTJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms