Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCHNA4D1U4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCHNA4D1U4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCHNA4D1U4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCHNA4D1U4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms