Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TARSL2A2RTX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TARSL2A2RTX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARSL2A2RTX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TARSL2A2RTX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TARSL2A2RTX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TARSL2A2RTX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TARSL2A2RTX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms