Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1W2PPC1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1W2PPC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1W2PPC1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PPC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms