Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1V0

IGHV3-15, Immunoglobulin heavy variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-15A0A0B4J1V0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-15A0A0B4J1V0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-15A0A0B4J1V0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-15A0A0B4J1V0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.7 ms