Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6K0

IGLV3-16, Immunoglobulin lambda variable 3-16, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-16A0A075B6K0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-16A0A075B6K0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGLV3-16A0A075B6K0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGLV3-16A0A075B6K0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGLV3-16A0A075B6K0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGLV3-16A0A075B6K0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGLV3-16A0A075B6K0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGLV3-16A0A075B6K0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGLV3-16A0A075B6K0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGLV3-16A0A075B6K0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms