Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRYD3Q8NCJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms