Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3KRW8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3KRW8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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