Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYH0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYH0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GYH0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GYH0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYH0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYH0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYH0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYH0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYH0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYH0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYH0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYH0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYH0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYH0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYH0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYH0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYH0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYH0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYH0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYH0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYH0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
V9GYH0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYH0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYH0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYH0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYH0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYH0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYH0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYH0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYH0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYH0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYH0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
V9GYH0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYH0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYH0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYH0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYH0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYH0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYH0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYH0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYH0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYH0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYH0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYH0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYH0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYH0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYH0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYH0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYH0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYH0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYH0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYH0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYH0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYH0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYH0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYH0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYH0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYH0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms