Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U3KQV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U3KQV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U3KQV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U3KQV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQV3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U3KQV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U3KQV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U3KQV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U3KQV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U3KQV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U3KQV3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U3KQV3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U3KQV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U3KQV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U3KQV3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U3KQV3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U3KQV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U3KQV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U3KQV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U3KQV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U3KQV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U3KQV3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U3KQV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U3KQV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U3KQV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U3KQV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U3KQV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U3KQV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U3KQV3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U3KQV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U3KQV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U3KQV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U3KQV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U3KQV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KQV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KQV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KQV3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KQV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KQV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQV3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KQV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KQV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KQV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms