Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SETBP1Q9Y6X0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETBP1Q9Y6X0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SETBP1Q9Y6X0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETBP1Q9Y6X0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SETBP1Q9Y6X0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SETBP1Q9Y6X0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms