Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1LI1Q9Y6G9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms