Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB3Q9Y5G1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB3Q9Y5G1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB3Q9Y5G1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB3Q9Y5G1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms