Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB11Q9Y547 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB11Q9Y547 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB11Q9Y547 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB11Q9Y547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms