Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
RAD54L2Q9Y4B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
RAD54L2Q9Y4B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.52■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RAD54L2Q9Y4B4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.44■■■■■ 4.55
RAD54L2Q9Y4B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.39■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
RAD54L2Q9Y4B4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms