Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM2Q9Y333 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM2Q9Y333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM2Q9Y333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM2Q9Y333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM2Q9Y333 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms