Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
TRAPPC8Q9Y2L5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms