Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK3Q9Y2K2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK3Q9Y2K2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIK3Q9Y2K2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIK3Q9Y2K2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms