Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EFR3BQ9Y2G0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFR3BQ9Y2G0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFR3BQ9Y2G0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFR3BQ9Y2G0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms