Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF3IP3Q9Y228 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF3IP3Q9Y228 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF3IP3Q9Y228 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF3IP3Q9Y228 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms