Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNEQ9Y223 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GNEQ9Y223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNEQ9Y223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNEQ9Y223 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNEQ9Y223 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms