Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP22Q9UPT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP22Q9UPT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP22Q9UPT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP22Q9UPT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms