Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRQQ9UMZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRQQ9UMZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRQQ9UMZ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms